Onkologické oddělení je tvořeno oddělením klinické onkologie a radioterapie. Zabývá se terapií solidních nádorů dospělých pacientů. Poskytuje základní i vysoce specializovanou léčebnou (radioterapie, protinádorová farmakoterapie), podpůrnou, paliativní a dispenzární péči pro onkologické pacienty.
Léčba nádorových onemocnění se opírá o léčebné standardy, které jsou pravidelně aktualizovány. Onkologické oddělení je stěžejní součástí Komplexního onkologického centra KNTB a.s. Zlín, které zahrnuje i další pracoviště Zlínského kraje. Ta se také věnují diagnostice a léčbě nádorových onemocnění včetně chirurgických pracovišť. Léčebný postup je probírán v rámci mezioborových indikačních komisí.