Kožní oddělení poskytuje komplexní diagnostickou a léčebnou péči pro děti a dospělé v celém spektru onemocnění kožních a pohlavních. Spolupracuje s praktickými lékaři a ambulantními specialisty Zlínského kraje.
Velký podíl návštěv tvoří pacienti s ekzémy, alergickými nebo imunitně podmíněnými onemocněními kůže, lupénkou, akné, chronickými ránami a kožními nádory. Pro pacienty je zajištěno nejmodernější léčebné spektrum celkové a zevní terapie včetně léčebných koupelí a světloléčby. K dispozici jsou lokální a celotělové zářiče obsahující všechny potřebné terapeutické vlnové délky UV záření i excimerové světlo.
K diagnostice alergických onemocnění kůže jsou k dispozici speciální alergeny k epikutánním testům. K léčbě bércových vředů je určena samostatná místnost k převazům. Pro onemocnění žil a mízního systému je oddělení vybaveno kvalitními přístroji pro kompresivní terapii a jsou prováděny manuální lymfodrenáže. Pro nemocné s pohlavními chorobami jsou zajištěny izolační pokoje.
K diagnostice pigmentových projevů na kůži, především névů a kožních nádorů, slouží ruční dermatoskopy a nejmodernější digitální dermatoskop, který je vybaven celotělovým skenerem.
Specializovaná ambulance pro mateřská znaménka slouží obyvatelům Zlínského kraje od roku 2016. Kožní oddělení je součástí Komplexního onkologického centra KNTB s provozem onkodermatologické ambulance. Nabízí také centrovou péči pro Zlínský kraj, kam patří biologická léčba těžké psoriázy, chronické urtikarie či atopického ekzému.